Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Crocc2F6XLV1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Crocc2F6XLV1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crocc2F6XLV1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms