Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm10477F6SW83 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10477F6SW83 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm10477F6SW83 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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