Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc7bE9Q9Y3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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