Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms