Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930546C10RikE9Q4Y3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930546C10RikE9Q4Y3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms