Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms