Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4930426L09RikE9Q0N7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930426L09RikE9Q0N7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms