Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl3lE9PWZ3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3lE9PWZ3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms