Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc62E9PVD1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms