Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
5430403G16RikD3Z5L4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms