Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Catsperg2C6KI89 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsperg2C6KI89 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms