Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Gm17333C6EQI3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm17333C6EQI3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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