Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzd8B9EJ80 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms