Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm6133B2RY53 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms