Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
1700042G07RikB1AUF7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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1700042G07RikB1AUF7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
1700042G07RikB1AUF7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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