Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3173A6NAS3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3173A6NAS3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3173A6NAS3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3173A6NAS3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3173A6NAS3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3173A6NAS3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3173A6NAS3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3173A6NAS3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm3173A6NAS3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms