Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms