Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms