Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ttll9A2APC3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttll9A2APC3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms