Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc163A2AGD7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc163A2AGD7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms