Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE2

Trbv3, T cell receptor beta, variable 3 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv3A0A0A6YYE2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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