Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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