Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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