Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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