Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC073188.3-201ENST00000425228 339 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ECHS1P30084 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms