Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
PTPRCP08575 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTPRCP08575 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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