Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EHD3Q9NZN3 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms