Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Mir1191-201ENSMUST00000116883 120 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm24648-201ENSMUST00000157111 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Hoxd11P23813 Gm11694-201ENSMUST00000118637 159 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm25629-201ENSMUST00000084001 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd11P23813 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms