Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM4SF4P48230 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TM4SF4P48230 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms