Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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