Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm24686-201ENSMUST00000157755 93 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 AC238676.2-201ENSMUST00000220910 94 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Hoxd11P23813 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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