Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GPS1Q13098 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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