Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Speer3W4VSP1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Speer3W4VSP1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Speer3W4VSP1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms