Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdac5Q9Z2V6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hdac5Q9Z2V6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac5Q9Z2V6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms