Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mbd3Q9Z2D8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mbd3Q9Z2D8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms