Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clic1Q9Z1Q5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms