Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms