Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacsin2Q9WVE8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pacsin2Q9WVE8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms