Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cited4Q9WUL8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cited4Q9WUL8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cited4Q9WUL8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Cited4Q9WUL8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cited4Q9WUL8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cited4Q9WUL8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cited4Q9WUL8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cited4Q9WUL8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cited4Q9WUL8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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