Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scnn1bQ9WU38 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scnn1bQ9WU38 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms