Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnurfQ9WU12 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms