Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema6cQ9WTM3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema6cQ9WTM3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms