Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx6Q9R1R0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx6Q9R1R0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms