Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slit2Q9R1B9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slit2Q9R1B9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slit2Q9R1B9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slit2Q9R1B9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms