Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NrkQ9R0G8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms