Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Znf346Q9R0B7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf346Q9R0B7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms