Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sh2d3cQ9QZS8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh2d3cQ9QZS8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms