Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf10bQ9QZM4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms