Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnnt3Q9QZ47 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms