Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms